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三代宏基因组测序在食源性疾病事件中的应用

刘丽,杨小蓉,彭凯,孙欣然,王乐

目的 探索三代宏基因组测序在食源性疾病事件中病原菌快速识别的运用。方法 随机选取1份2021年四川某地食源性疾病事件中的腹泻样本作为研究对象,应用三代宏基因组建库测序,基于测序数据进行快速识别引起食源性疾病的病原体。结果 传统分离鉴定方法经过3 d分离鉴定出由肠炎沙门引起的食源性疾病暴发事件,宏基因组测序6 h就能快速识别出丰度很高的肠炎沙门菌。结论 三代宏基因组测序技术在处理食源性疾病事件中时效性性及准确性较高,具有一定的可行性。